RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.9□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C22orf24Q9Y442 160 aa6.89□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MT1HL1P0DM35 61 aa6.87□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.87□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKCP01834 107 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV7-43P04211 117 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HERV-K104P63124 156 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC01545Q5VT33 79 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PET117Q6UWS5 81 aa6.85□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1orf137Q5JT78 98 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.84□□□□□ -1.31
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00167Q96N53 147 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H0Y8G0 127 aa6.82□□□□□ -1.32
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NMUP48645 174 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP10-8P60410 259 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8NDZ9 215 aa6.82□□□□□ -1.32
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C3orf79P0CE67 100 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2BP63146 152 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REG3GQ6UW15 175 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.81□□□□□ -1.32
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HERVK_113P61574 105 aa6.8□□□□□ -1.32
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H0Y9J4 135 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM13P0DJ93 91 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00158P58513 81 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BCE1O60756 84 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.76□□□□□ -1.33
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKR1D1P51857 326 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCE4AQ5TA78 99 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.76□□□□□ -1.33
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LITAFQ99732 161 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TIMM17BO60830 172 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFC2O95298 119 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTDAPP60985 99 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM126AQ9H061 195 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPRR1AP35321 89 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C20orf202A1L168 122 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV2D-28P01615 120 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C5orf52A6NGY3 159 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM238C9JI98 176 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DAND5Q8N907 189 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRP2P98164 4655 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRYO14603 147 aa6.68□□□□□ -1.34
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