RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 K7EMI3 77 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 TIMM17AQ99595 171 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 MUC17Q685J3 4493 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01546A6NGU7 62 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 COX7B2Q8TF08 81 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 TOMM6Q96B49 74 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 A0A096LNJ9 63 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 HBDP02042 147 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 UBE2AP49459 152 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2D-28P01615 120 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 SPINK8P0C7L1 97 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 H0Y8G0 127 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 LEPROTL1O95214 131 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 G0S2P27469 103 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 AKR1D1P51857 326 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 ERASQ7Z444 233 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 KRTDAPP60985 99 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 PRLHP81277 87 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 CDIP1Q9H305 208 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 ATP5LO75964 103 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 C3orf79P0CE67 100 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 PFN2P35080 140 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 CST9LQ9H4G1 147 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM238C9JI98 176 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 H3BRM9 83 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 PMVKQ15126 192 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 TPRXLQ17RH7 258 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM126AQ9H061 195 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01549A6NIU2 74 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 SCGB1D1O95968 90 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 VPREB1P12018 145 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 ERG28Q9UKR5 140 aa6.73□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 PET117Q6UWS5 81 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 ATOH7Q8N100 152 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 Q8NDZ9 215 aa6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GARNL3-210ENST00000453030 M0R378 163 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 IGLC3P0DOY3 106 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 C20orf202A1L168 122 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 PYY3Q5JQD4 70 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01545Q5VT33 79 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 GHRHP01286 108 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 COX17Q14061 63 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 DPM2O94777 84 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 IGKCP01834 107 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 C11orf86A6NJI1 115 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 CTAG1AP78358 180 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 SPRR4Q96PI1 79 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0U1RRA0 63 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM6P0DI80 62 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00158P58513 81 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-210ENST00000453030 PLNP26678 52 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 SFTA2Q6UW10 78 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 DAND5Q8N907 189 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 Q8NBF4 154 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 C12orf57Q99622 126 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 VAMP8Q9BV40 100 aa6.63□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.63□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.62□□□□□ -1.35
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