RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0U1RRA0	63 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	LEPROT	O15243	131 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	S100A6	P06703	90 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	S100A2	P29034	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	PCP4	P48539	62 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	KRTDAP	P60985	99 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	C20orf202	A1L168	122 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CITED1-208	ENST00000450875		J3QQQ9	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	TRIAP1	O43715	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	OXT	P01178	125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	NMU	P48645	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875		E9PLD3	99 aa		5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	AKR1D1	P51857	326 aa		5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	REG3G	Q6UW15	175 aa		5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	LINC00167	Q96N53	147 aa		5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	VPREB1	P12018	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CITED1-208	ENST00000450875	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0J9YXY3	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875		M0R378	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	BCE1	O60756	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	S100A12	P80511	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	DAND5	Q8N907	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	NCR3	O14931	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF861P	O60384	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	UBE2A	P49459	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875		H0Y9J4	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	NPC2	P61916	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875		Q8NDZ9	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	TIMM17B	O60830	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	PRY	O14603	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	NDUFC2	O95298	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	DDT	P30046	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-208	ENST00000450875	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	PRLH	P81277	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-208	ENST00000450875	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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