RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	COLCA2	A8K830	154 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM126A	Q9H061	195 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1G1	O75348	118 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM238	C9JI98	176 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R378	163 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PRLH	P81277	87 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPAN13	O95857	204 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGC2	P03986	189 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A1	P23297	94 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00158	P58513	81 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	HSBP1	O75506	76 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0U1RRA0	63 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM13	P0DJ93	91 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00310	P59036	64 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	HERV-K104	P63124	156 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00587	B1AMM8	73 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	SERF1A	O75920	110 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR1A	P35321	89 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	CTAG1A	P78358	180 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	PRY	O14603	147 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738		H0Y8G0	127 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	NCR3	O14931	201 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR4	Q96PI1	79 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC17	Q685J3	4493 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	LEPROT	O15243	131 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	PLN	P26678	52 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738		J3QQQ9	107 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	DPM2	O94777	84 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP4	P15090	132 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	DAND5	Q8N907	189 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKC	P01834	107 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	NMU	P48645	174 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	HERVK_113	P61574	105 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	TPRXL	Q17RH7	258 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL28-203	ENST00000429738		B5MCH6	92 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00483	Q53H64	154 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CDIP1	Q9H305	208 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFC2	O95298	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	DDT	P30046	118 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A12	P80511	92 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV6-57	P01721	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738		E9PLD3	99 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	ERC2-IT1	O76042	136 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8NBF4	154 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738		Q9BRP9	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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