RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420709.5

PRAME-207, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene PRAME, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-207ENST00000420709 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 TRGC2P03986 189 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 IGLC3P0DOY3 106 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 PMCHL1Q16048 86 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 Q8NDZ9 215 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 TMEM126AQ9H061 195 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 ERG28Q9UKR5 140 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 COLCA2A8K830 154 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 CTAG1AP78358 180 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 BAGE3Q86Y29 109 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 M0R378 163 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 LCE2BO14633 110 aa7.41□□□□□ -1.22
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PRAME-207ENST00000420709 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 CDIP1Q9H305 208 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-207ENST00000420709 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.4□□□□□ -1.22
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PRAME-207ENST00000420709 C11orf86A6NJI1 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-207ENST00000420709 S100A1P23297 94 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-207ENST00000420709 COX17Q14061 63 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-207ENST00000420709 TPRXLQ17RH7 258 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRAME-207ENST00000420709 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-207ENST00000420709 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRAME-207ENST00000420709 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.37□□□□□ -1.23
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PRAME-207ENST00000420709 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-207ENST00000420709 SERF1AO75920 110 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRAME-207ENST00000420709 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRAME-207ENST00000420709 LEPROTL1O95214 131 aa7.34□□□□□ -1.23
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PRAME-207ENST00000420709 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 NCR3O14931 201 aa7.32□□□□□ -1.24
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PRAME-207ENST00000420709 TMEM223A0PJW6 202 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 HIST1H2BKO60814 126 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 HIST1H2BJP06899 126 aa7.31□□□□□ -1.24
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PRAME-207ENST00000420709 HIST1H2BOP23527 126 aa7.31□□□□□ -1.24
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PRAME-207ENST00000420709 HIST1H2BDP58876 126 aa7.31□□□□□ -1.24
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PRAME-207ENST00000420709 H0Y8G0 127 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 FABP4P15090 132 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 Q8NBF4 154 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 PRYO14603 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-207ENST00000420709 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.27□□□□□ -1.25
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PRAME-207ENST00000420709 PLNP26678 52 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 SPRR1AP35321 89 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 DPM2O94777 84 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 IGKCP01834 107 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 HERV-K104P63124 156 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 LINC00587B1AMM8 73 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 ERC2-IT1O76042 136 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRAME-207ENST00000420709 HERVK_113P61574 105 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 MOBPQ13875 183 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 LINC00483Q53H64 154 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-207ENST00000420709 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-207ENST00000420709 B5MCH6 92 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-207ENST00000420709 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-207ENST00000420709 LEPROTO15243 131 aa7.21□□□□□ -1.26
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