RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918		Q8N814	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918		Q8NAQ8	132 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	LYST	Q99698	3801 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A1B0GX51	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	CCK	P06307	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZQY7	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	COX7C	P15954	63 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6JHZ5	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	UQCRQ	O14949	82 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	APOC4	P55056	127 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	NDUFC2	O95298	119 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	LELP1	Q5T871	98 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZTC4	211 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	COX17	Q14061	63 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	MIF	P14174	115 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZRU5	148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	ATOX1	O00244	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZQT0	140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A0J9YWU9	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	HAMP	P81172	84 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	GHRH	P01286	108 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	ESRG	Q1W209	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	OXT	P01178	125 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	CRYGA	P11844	174 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZRP5	223 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918		Q8N9L7	120 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CAGE1-203	ENST00000379918	VPREB1	P12018	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZVQ6	151 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	COX7B	P24311	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAGE1-203	ENST00000379918	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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