RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 A0A087WYN8 130 aa7.95□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 A0A0U1RRA0 63 aa7.95□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 PTTG1IPP53801 180 aa7.95□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 LINC00158P58513 81 aa7.95□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.95□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.95□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 A0A0J9YXY3 114 aa7.94□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 LINC00587B1AMM8 73 aa7.94□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 SMIM13P0DJ93 91 aa7.94□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 COX17Q14061 63 aa7.94□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 SPATA45Q537H7 98 aa7.94□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.92□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.92□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 COX8AP10176 69 aa7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 C14orf144Q96I85 54 aa7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.9□□□□□ -1.14
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 S100A12P80511 92 aa7.89□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.89□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 DAND5Q8N907 189 aa7.89□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.89□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PNN7 141 aa7.88□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 TIMM17BO60830 172 aa7.88□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.88□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 LITAFQ99732 161 aa7.88□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 FAT1Q14517 4588 aa7.88□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 FAM168BA1KXE4 195 aa7.87□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 SMIM6P0DI80 62 aa7.87□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.87□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.87□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 DLEU1O43261 78 aa7.86□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.86□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.86□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.85□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 TMEM238C9JI98 176 aa7.85□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.85□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 NPC2P61916 151 aa7.84□□□□□ -1.15
CNMD-201ENST00000377962 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 SPANXCQ9NY87 97 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.83□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 Q8NDZ9 215 aa7.82□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 C12orf57Q99622 126 aa7.82□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 VPREB1P12018 145 aa7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 Q6ZVH6 145 aa7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 C22orf24Q9Y442 160 aa7.81□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.8□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.8□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.8□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 C7orf33Q8WU49 177 aa7.8□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 PRO1933Q9H354 126 aa7.8□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.79□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 M0QXV9 152 aa7.79□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 IFITM1P13164 125 aa7.79□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.79□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 HIGD1BQ9P298 99 aa7.79□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.79□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 COPS9Q8WXC6 57 aa7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 HIST1H4GQ99525 98 aa7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 LINC00167Q96N53 147 aa7.78□□□□□ -1.16
CNMD-201ENST00000377962 GAGE10A6NGK3 116 aa7.77□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 NDUFC2O95298 119 aa7.77□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 M0R378 163 aa7.76□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 NCR3O14931 201 aa7.76□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.76□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.75□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 UBE2BP63146 152 aa7.75□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 HERC1Q15751 4861 aa7.74□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.74□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.73□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.73□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 IGKV2D-28P01615 120 aa7.73□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 TAL2Q16559 108 aa7.73□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.72□□□□□ -1.17
CNMD-201ENST00000377962 A4D1N5 150 aa7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms