RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.98□□□□□ -0.97
HCN3-201ENST00000368358 SNCGO76070 127 aa8.97□□□□□ -0.97
HCN3-201ENST00000368358 H3BNG1 76 aa8.96□□□□□ -0.97
HCN3-201ENST00000368358 H3BT86 120 aa8.96□□□□□ -0.97
HCN3-201ENST00000368358 C6orf99Q4VX62 202 aa8.96□□□□□ -0.97
HCN3-201ENST00000368358 TTC32Q5I0X7 151 aa8.96□□□□□ -0.97
HCN3-201ENST00000368358 TMEM126AQ9H061 195 aa8.95□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 ANK2Q01484 3957 aa8.95□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.94□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 XGP55808 180 aa8.94□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 H0YGX0 51 aa8.93□□□□□ -0.98
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HCN3-201ENST00000368358 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.93□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZRU5 148 aa8.92□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.92□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 COL7A1Q02388 2944 aa8.92□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 CASC10Q5T4H9 136 aa8.92□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 RMI2Q96E14 147 aa8.92□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 PRR34Q9NV39 138 aa8.92□□□□□ -0.98
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.91□□□□□ -0.98
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HCN3-201ENST00000368358 CDIP1Q9H305 208 aa8.91□□□□□ -0.98
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HCN3-201ENST00000368358 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.9□□□□□ -0.98
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HCN3-201ENST00000368358 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
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HCN3-201ENST00000368358 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.88□□□□□ -0.99
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HCN3-201ENST00000368358 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.87□□□□□ -0.99
HCN3-201ENST00000368358 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.87□□□□□ -0.99
HCN3-201ENST00000368358 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.87□□□□□ -0.99
HCN3-201ENST00000368358 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.86□□□□□ -0.99
HCN3-201ENST00000368358 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.85□□□□□ -0.99
HCN3-201ENST00000368358 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.84□□□□□ -0.99
HCN3-201ENST00000368358 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 C15orf56Q8N910 161 aa8.83□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.83□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 DIRC1Q969H9 104 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 APLNQ9ULZ1 77 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 FBN3Q75N90 2809 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZQY7 126 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 hADV29S1A0JD25 119 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 Q8N814 137 aa8.82□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 NDUFC2O95298 119 aa8.81□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
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HCN3-201ENST00000368358 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.81□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.81□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZRP5 223 aa8.8□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.8□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.79□□□□□ -1
HCN3-201ENST00000368358 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
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HCN3-201ENST00000368358 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.77□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.76□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 FAM168BA1KXE4 195 aa8.76□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 M0R378 163 aa8.75□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 LINC00575Q6W349 94 aa8.75□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 C2orf48Q96LS8 159 aa8.75□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.74□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.74□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.73□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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HCN3-201ENST00000368358 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 DSCR8Q96T75 97 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 VPREB1P12018 145 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 ACYP1P07311 99 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 CHTF8P0CG12 524 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 UBE2BP63146 152 aa8.72□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.71□□□□□ -1.01
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HCN3-201ENST00000368358 IGLV6-57P01721 117 aa8.71□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 UPK3BQ9BT76 320 aa8.71□□□□□ -1.01
HCN3-201ENST00000368358 HAMPP81172 84 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 C22orf24Q9Y442 160 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 SCGB1A1P11684 91 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 LINC00846Q9NV44 126 aa8.7□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 C7orf33Q8WU49 177 aa8.69□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 LINC00643Q86TS7 51 aa8.68□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.67□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.67□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.67□□□□□ -1.02
HCN3-201ENST00000368358 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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