RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.2□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.2□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 RNF151Q2KHN1 245 aa8.19□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 TEN1Q86WV5 123 aa8.19□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 LINC01600Q96MT4 127 aa8.19□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.19□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.18□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.18□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 TRACP01848 142 aa8.18□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.17□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 H3BT86 120 aa8.17□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 CARD19Q96LW7 228 aa8.17□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM126AQ9H061 195 aa8.17□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.16□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 H0YGX0 51 aa8.16□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 COL7A1Q02388 2944 aa8.16□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.16□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.16□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.16□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ZNF548-201ENST00000336128 J3QR89 54 aa8.15□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 LECT2O14960 151 aa8.15□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 SLPIP03973 132 aa8.15□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 GAGE2EQ4V326 116 aa8.15□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.15□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 A0A087WYN8 130 aa8.14□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZRP5 223 aa8.14□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 VPREB1P12018 145 aa8.14□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 DNHD1Q96M86 4753 aa8.14□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV6-57P01721 117 aa8.13□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 VPS25Q9BRG1 176 aa8.13□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.12□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.11□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf99Q4VX62 202 aa8.11□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 DNAL4O96015 105 aa8.1□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.1□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 M0R378 163 aa8.09□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 PSCAO43653 123 aa8.09□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 TTC32Q5I0X7 151 aa8.09□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.09□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.09□□□□□ -1.11
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.08□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GX51 115 aa8.07□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 C22orf24Q9Y442 160 aa8.07□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.06□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.06□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 GAGE2BQ13066 116 aa8.06□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 Q8N814 137 aa8.06□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 DIRC1Q969H9 104 aa8.06□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00167Q96N53 147 aa8.06□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.05□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00575Q6W349 94 aa8.05□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.05□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 C14orf177Q52M58 125 aa8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.04□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 C7orf33Q8WU49 177 aa8.03□□□□□ -1.12
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 FAM168BA1KXE4 195 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 SNCGO76070 127 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 COX7BP24311 80 aa8.02□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 hADV29S1A0JD25 119 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 M0R2N4 97 aa8.01□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 CDIP1Q9H305 208 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 STARD9Q9P2P6 4700 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 CSMD3Q7Z407 3707 aa8□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.99□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 A0A096LNI7 61 aa7.98□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 C16orf90A8MZG2 172 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 LYSTQ99698 3801 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.97□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.96□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.96□□□□□ -1.13
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.96□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.96□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.96□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZQY7 126 aa7.96□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZR54 194 aa7.96□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.95□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 PRYO14603 147 aa7.95□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ZNF548-201ENST00000336128 SIGMAR1Q99720 223 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms