RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 FHL3Q13643 280 aa7.48□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.47□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.47□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 C10orf142B7Z368 130 aa7.47□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 C16orf90A8MZG2 172 aa7.46□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 LIMD2Q9BT23 127 aa7.46□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 MTORP42345 2549 aa7.46□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 ACANP16112 2415 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 hDV103S1A0JD37 113 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 KIAA0087Q14695 138 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 F8P00451 2351 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 FAM229AH3BQW9 127 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 Q6JHZ5 121 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PPR1 153 aa7.44□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.44□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 J3QL48 77 aa7.44□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 SMIM29Q86T20 159 aa7.43□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 USP24Q9UPU5 2620 aa7.42□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.42□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 IMUPQ9GZP8 106 aa7.42□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.41□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 PCSK5Q92824 1860 aa7.41□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GU69 56 aa7.41□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.4□□□□□ -1.22
CLN8-201ENST00000331222 TRIOO75962 3097 aa7.4□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 C16orf95Q9H693 158 aa7.4□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 Q96NJ1 140 aa7.39□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.38□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 RTL8CO15255 209 aa7.37□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 PRO3102Q9H379 93 aa7.37□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 LINC00313P59037 77 aa7.37□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 YPEL4Q96NS1 127 aa7.37□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 LINC00846Q9NV44 126 aa7.36□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.36□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 SZT2Q5T011 3432 aa7.36□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.36□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 LINC00167Q96N53 147 aa7.36□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 MUC7Q8TAX7 377 aa7.35□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.35□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 LINC00315P59091 139 aa7.35□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.34□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 C9orf92A6NGG3 77 aa7.34□□□□□ -1.23
CLN8-201ENST00000331222 AMELXQ99217 191 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 CNFNQ9BYD5 112 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GUV1 79 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 REV3LO60673 3130 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 FAM168BA1KXE4 195 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 ACYP2P14621 99 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.3□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.3□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 APLNQ9ULZ1 77 aa7.29□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 EPM2AB3EWF7 344 aa7.29□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.28□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 Q8N2B8 174 aa7.28□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.28□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 LINC00310P59036 64 aa7.28□□□□□ -1.24
CLN8-201ENST00000331222 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.27□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZRP5 223 aa7.24□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 LINC01554Q52M75 96 aa7.24□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 HTTP42858 3142 aa7.24□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.24□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 C4orf26Q17RF5 130 aa7.24□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.23□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 F8WDY8 70 aa7.23□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.23□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 VCANP13611 3396 aa7.23□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.23□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 A0A096LNJ9 63 aa7.22□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 IGLV6-57P01721 117 aa7.22□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 CXCL6P80162 114 aa7.22□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.22□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 COL6A3P12111 3177 aa7.22□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 LAMA1P25391 3075 aa7.22□□□□□ -1.25
CLN8-201ENST00000331222 SPEGQ15772 3267 aa7.21□□□□□ -1.25
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CLN8-201ENST00000331222 DSCR10P59022 87 aa7.2□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 AKAP13Q12802 2813 aa7.2□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 CDIP1Q9H305 208 aa7.2□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 COL4A2P08572 1712 aa7.19□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.19□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.19□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 Q8NBF4 154 aa7.19□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 A0A0G2JQZ4 141 aa7.18□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PNN7 141 aa7.18□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.17□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.17□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.17□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.17□□□□□ -1.26
CLN8-201ENST00000331222 MGAQ8IWI9 3026 aa7.17□□□□□ -1.26
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