RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SHQ1-201ENST00000325599 Q8NAQ8 132 aa11.21□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 DNAL4O96015 105 aa11.2□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 REG3AQ06141 175 aa11.2□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA0087Q14695 138 aa11.19□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.19□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.18□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.18□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 C20orf197Q8N268 126 aa11.17□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00846Q9NV44 126 aa11.17□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 LECT2O14960 151 aa11.16□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.16□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 SLPIP03973 132 aa11.15□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.15□□□□□ -0.62
SHQ1-201ENST00000325599 MIFP14174 115 aa11.14□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 H0YGX0 51 aa11.14□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 V9GYY9 64 aa11.14□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.14□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 GHRHP01286 108 aa11.14□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.13□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf223Q8N319 242 aa11.13□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 BRK1Q8WUW1 75 aa11.13□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 Q8NDZ9 215 aa11.12□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 C10orf25Q5T742 122 aa11.11□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 Q6JHZ5 121 aa11.11□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 KLK12Q9UKR0 248 aa11.1□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.1□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.09□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFC2O95298 119 aa11.09□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf195Q5TG92 126 aa11.09□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 LELP1Q5T871 98 aa11.09□□□□□ -0.63
SHQ1-201ENST00000325599 NCR3O14931 201 aa11.08□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 COX17Q14061 63 aa11.08□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 RETNQ9HD89 108 aa11.07□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.07□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 SPAG11BQ08648 103 aa11.06□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 ENHOQ6UWT2 76 aa11.06□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.06□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.06□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.05□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.05□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.05□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 PRR34Q9NV39 138 aa11.04□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.03□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.03□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 F8P00451 2351 aa11.03□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.03□□□□□ -0.64
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-11P60412 298 aa11.02□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf99Q4VX62 202 aa11.02□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 Q8N814 137 aa11.02□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 SNURFQ9Y675 71 aa11.02□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 ANK2Q01484 3957 aa11.01□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 H7BZZ5 65 aa11.01□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 TENM3Q9P273 2699 aa11□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 S100A7L2Q5SY68 101 aa11□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.99□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 EPM2AB3EWF7 344 aa10.99□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 STAB1Q9NY15 2570 aa10.98□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0J9YWU9 116 aa10.98□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00167Q96N53 147 aa10.98□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZTC4 211 aa10.97□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 RMI2Q96E14 147 aa10.97□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.97□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.97□□□□□ -0.65
SHQ1-201ENST00000325599 HIGD2BQ4VC39 106 aa10.95□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.95□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 F8WEM9 126 aa10.94□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00575Q6W349 94 aa10.93□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.92□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.92□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV6-57P01721 117 aa10.91□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 ESRGQ1W209 222 aa10.91□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 CCKP06307 115 aa10.91□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.9□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.9□□□□□ -0.66
SHQ1-201ENST00000325599 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.89□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.89□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.89□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.88□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.88□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 MUC7Q8TAX7 377 aa10.88□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 NOTCH1P46531 2555 aa10.88□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 H3BNG1 76 aa10.87□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZRU5 148 aa10.86□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 MAST4O15021 2626 aa10.86□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 C15orf56Q8N910 161 aa10.86□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.85□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.85□□□□□ -0.67
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms