RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 COX7B2Q8TF08 81 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR4Q96PI1 79 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 NPYP01303 97 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB14P61106 215 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 AMELXQ99217 191 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 V9GYV3 84 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 PRELID3AQ96N28 172 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM238C9JI98 176 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R378 163 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01549A6NIU2 74 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BRM9 83 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 COX17Q14061 63 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N377 158 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS47A8MTI9 375 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 PFN2P35080 140 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 PCOTHQ58A44 107 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SFTA2Q6UW10 78 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N8P6 123 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM17AQ99595 171 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SCO1O75880 301 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 VPREB1P12018 145 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ADIRFQ15847 76 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf57Q99622 126 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 IGIPA6NJ69 53 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM6P0DI80 62 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 MOBPQ13875 183 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMD2Q9BT23 127 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT8Q9UHE5 227 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00587B1AMM8 73 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 PRYO14603 147 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CFC1P0CG37 223 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ERASQ7Z444 233 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ERG28Q9UKR5 140 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GXF2 115 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK8P0C7L1 97 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 S100PP25815 95 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00483Q53H64 154 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CLLU1Q5K131 121 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM6Q96B49 74 aa4.29□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 PCP4P48539 62 aa4.28□□□□□ -1.72
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00158P58513 81 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf92A6NGG3 77 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PMVKQ15126 192 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD7Q86VX2 200 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CST9LQ9H4G1 147 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV6-57P01721 117 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PEA15Q15121 130 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 FA2HQ7L5A8 372 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00846Q9NV44 126 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR1AP35321 89 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.23□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.23□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.22□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1D1P51857 326 aa4.22□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.22□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6Q795 121 aa4.22□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.22□□□□□ -1.73
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf52A6NGY3 159 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-ND4LP03901 98 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLC3P0DOY3 106 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms