RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 IGKCP01834 107 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP41-201ENST00000292729 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP41-201ENST00000292729 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.05□□□□□ -1.44
USP41-201ENST00000292729 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP41-201ENST00000292729 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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USP41-201ENST00000292729 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP41-201ENST00000292729 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP41-201ENST00000292729 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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USP41-201ENST00000292729 PRO1933Q9H354 126 aa6.02□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.02□□□□□ -1.45
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USP41-201ENST00000292729 HERVK_113P61574 105 aa6.01□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.01□□□□□ -1.45
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USP41-201ENST00000292729 BCE1O60756 84 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 SEC11AP67812 179 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6□□□□□ -1.45
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USP41-201ENST00000292729 CST9LQ9H4G1 147 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 C22orf24Q9Y442 160 aa6□□□□□ -1.45
USP41-201ENST00000292729 C11orf86A6NJI1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
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USP41-201ENST00000292729 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.97□□□□□ -1.45
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USP41-201ENST00000292729 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.97□□□□□ -1.45
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USP41-201ENST00000292729 C14orf144Q96I85 54 aa5.96□□□□□ -1.46
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USP41-201ENST00000292729 M0R143 59 aa5.95□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 NMUP48645 174 aa5.95□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 HERVK_113P63121 156 aa5.95□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 FAM104AQ969W3 186 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP41-201ENST00000292729 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.94□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.94□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.94□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.94□□□□□ -1.46
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USP41-201ENST00000292729 TMEM223A0PJW6 202 aa5.93□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 CFC1BP0CG36 223 aa5.93□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 UBE2AP49459 152 aa5.93□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.93□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.93□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.93□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 LEPROTO15243 131 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 PRSS2P07478 247 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 CKS1BP61024 79 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 HSD52Q0P140 79 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 TAL2Q16559 108 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 LINC00167Q96N53 147 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.92□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.91□□□□□ -1.46
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USP41-201ENST00000292729 PCP2Q8IVA1 136 aa5.91□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.9□□□□□ -1.46
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USP41-201ENST00000292729 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.9□□□□□ -1.46
USP41-201ENST00000292729 ZNF815PA8K554 130 aa5.89□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.89□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 LCE2CQ5TA81 110 aa5.89□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 SFTA2Q6UW10 78 aa5.89□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 Q8IZM0 81 aa5.89□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.88□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.88□□□□□ -1.47
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