RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZS46 218 aa9.49□□□□□ -0.89
PRDM16-201ENST00000270722 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.49□□□□□ -0.89
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PRDM16-201ENST00000270722 KLKP1Q107X0 134 aa9.48□□□□□ -0.89
PRDM16-201ENST00000270722 COX6A2Q02221 97 aa9.47□□□□□ -0.89
PRDM16-201ENST00000270722 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.47□□□□□ -0.89
PRDM16-201ENST00000270722 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.46□□□□□ -0.89
PRDM16-201ENST00000270722 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.46□□□□□ -0.9
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PRDM16-201ENST00000270722 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.45□□□□□ -0.9
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.45□□□□□ -0.9
PRDM16-201ENST00000270722 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.45□□□□□ -0.9
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PRDM16-201ENST00000270722 H7BZZ5 65 aa9.26□□□□□ -0.93
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.26□□□□□ -0.93
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZQT0 140 aa9.25□□□□□ -0.93
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PRDM16-201ENST00000270722 Q75L30 129 aa9.18□□□□□ -0.94
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00167Q96N53 147 aa9.16□□□□□ -0.94
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PRDM16-201ENST00000270722 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PRDM16-201ENST00000270722 CDSNQ15517 529 aa9.15□□□□□ -0.94
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZRX8 168 aa9.15□□□□□ -0.94
PRDM16-201ENST00000270722 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.15□□□□□ -0.94
PRDM16-201ENST00000270722 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRDM16-201ENST00000270722 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.14□□□□□ -0.95
PRDM16-201ENST00000270722 IGLV7-43P04211 117 aa9.14□□□□□ -0.95
PRDM16-201ENST00000270722 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.14□□□□□ -0.95
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