RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 REG3GQ6UW15 175 aa13.66□□□□□ -0.22
TTYH3-201ENST00000258796 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.66□□□□□ -0.22
TTYH3-201ENST00000258796 PRO0628Q9UI54 55 aa13.66□□□□□ -0.22
TTYH3-201ENST00000258796 A0A087WSZ3 146 aa13.65□□□□□ -0.22
TTYH3-201ENST00000258796 DEFB116Q30KQ4 102 aa13.65□□□□□ -0.22
TTYH3-201ENST00000258796 C16orf95Q9H693 158 aa13.65□□□□□ -0.22
TTYH3-201ENST00000258796 C10orf25Q5T742 122 aa13.64□□□□□ -0.23
TTYH3-201ENST00000258796 BCE1O60756 84 aa13.63□□□□□ -0.23
TTYH3-201ENST00000258796 Q6ZQT0 140 aa13.62□□□□□ -0.23
TTYH3-201ENST00000258796 HCG22E2RYF7 251 aa13.58□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 KIAA0087Q14695 138 aa13.58□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 SMIM29Q86T20 159 aa13.58□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.57□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 Q9BRP9 147 aa13.56□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 F8WDY8 70 aa13.56□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 H0Y9P7 68 aa13.56□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 PCOTHQ58A44 107 aa13.55□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 HTTP42858 3142 aa13.55□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa13.55□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 CFAP54Q96N23 3096 aa13.54□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 TM2D3Q9BRN9 247 aa13.53□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 C7orf33Q8WU49 177 aa13.52□□□□□ -0.24
TTYH3-201ENST00000258796 M0R2N4 97 aa13.52□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 IL17DQ8TAD2 202 aa13.52□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.5□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 F8P00451 2351 aa13.5□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 PRLHP81277 87 aa13.5□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 CHD9Q3L8U1 2897 aa13.49□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa13.48□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 hDV103S1A0JD37 113 aa13.48□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 C22orf24Q9Y442 160 aa13.48□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 X6R8D5 127 aa13.47□□□□□ -0.25
TTYH3-201ENST00000258796 C1orf64Q8NEQ6 169 aa13.43□□□□□ -0.26
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00167Q96N53 147 aa13.42□□□□□ -0.26
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF575Q86XF7 245 aa13.42□□□□□ -0.26
TTYH3-201ENST00000258796 K7ERS5 55 aa13.38□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 Q8NBF4 154 aa13.38□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.37□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 A0A1B0GW54 56 aa13.37□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 IGLV6-57P01721 117 aa13.36□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 LIMD2Q9BT23 127 aa13.36□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.34□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 LAMA3Q16787 3333 aa13.34□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 USP24Q9UPU5 2620 aa13.34□□□□□ -0.27
TTYH3-201ENST00000258796 Q6ZRX8 168 aa13.33□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 FSHBP01225 129 aa13.31□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa13.3□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 VPREB1P12018 145 aa13.3□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.29□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 KLKP1Q107X0 134 aa13.28□□□□□ -0.28
TTYH3-201ENST00000258796 BRCA2P51587 3418 aa13.26□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 CENPEQ02224 2701 aa13.26□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 RETNLBQ9BQ08 111 aa13.26□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13.25□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 Q6ZRP5 223 aa13.25□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 Q8NAQ8 132 aa13.25□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 H3BNG1 76 aa13.24□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 ERC2-IT1O76042 136 aa13.24□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 H7BZZ5 65 aa13.22□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 TRANK1O15050 2925 aa13.22□□□□□ -0.29
TTYH3-201ENST00000258796 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.21□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 LINC01600Q96MT4 127 aa13.21□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.2□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.19□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 SPAG11AQ6PDA7 123 aa13.18□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa13.18□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 K7EQZ3 153 aa13.18□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 LY6G6CO95867 125 aa13.18□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 H3BPC8 53 aa13.18□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 TRAV22A0A0B4J277 110 aa13.16□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 SPINK1P00995 79 aa13.16□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 NUPR2A6NF83 97 aa13.15□□□□□ -0.3
TTYH3-201ENST00000258796 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.14□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.13□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.13□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.13□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 A8MUN3 132 aa13.12□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 KCNQ1DNQ9H478 68 aa13.11□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 FAM168BA1KXE4 195 aa13.11□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 PRR34Q9NV39 138 aa13.1□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 EPM2AB3EWF7 344 aa13.09□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.09□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 MGAQ8IWI9 3026 aa13.09□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 MOBPQ13875 183 aa13.09□□□□□ -0.31
TTYH3-201ENST00000258796 FAM104AQ969W3 186 aa13.08□□□□□ -0.32
TTYH3-201ENST00000258796 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.07□□□□□ -0.32
TTYH3-201ENST00000258796 MGAM2Q2M2H8 2515 aa13.07□□□□□ -0.32
TTYH3-201ENST00000258796 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.07□□□□□ -0.32
TTYH3-201ENST00000258796 Q8N377 158 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms