RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 LMO4P61968 165 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf48Q96LS8 159 aa13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf64Q8NEQ6 169 aa13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJ-207ENST00000613246 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.23□□□□□ -0.29
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PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV22A0A0B4J277 110 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 APLNQ9ULZ1 77 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 Q6ZSN1 163 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 CHTF8P0CG12 524 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRJ-207ENST00000613246 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCA12Q86UK0 2595 aa13.08□□□□□ -0.32
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