RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.29□□□□□ -1.24
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GGA3-204ENST00000578208 ATP5LO75964 103 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 Q6ZRP5 223 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 YPEL4Q96NS1 127 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 A0A1W2PNN7 141 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-204ENST00000578208 UBE2BP63146 152 aa7.21□□□□□ -1.26
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GGA3-204ENST00000578208 SERF1AO75920 110 aa7.17□□□□□ -1.26
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GGA3-204ENST00000578208 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 DIRC1Q969H9 104 aa7.14□□□□□ -1.27
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GGA3-204ENST00000578208 ODF1Q14990 250 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-204ENST00000578208 NUPR1O60356 82 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-204ENST00000578208 MT1HL1P0DM35 61 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 FABP4P15090 132 aa7.11□□□□□ -1.27
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GGA3-204ENST00000578208 HERV-K104P63124 156 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 A0A0U1RRA0 63 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 HIST1H2BKO60814 126 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 IGKCP01834 107 aa7.07□□□□□ -1.28
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