RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf82Q6UX34 121 aa21.19■□□□□ 0.98
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01545Q5VT33 79 aa20.98■□□□□ 0.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 E9PLD3 99 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HERV-K104P63124 156 aa20.79■□□□□ 0.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa20.78■□□□□ 0.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QXV9 152 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM13P0DJ93 91 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa20.66■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa20.63■□□□□ 0.89
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