RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-215ENST00000563295 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.24□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 C20orf202A1L168 122 aa6.23□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 UBE2D1P51668 147 aa6.23□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 AMELXQ99217 191 aa6.23□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.23□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 A0A0J9YXV3 536 aa6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 ATP5LO75964 103 aa6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 TOMM6Q96B49 74 aa6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.22□□□□□ -1.41
KIFC3-215ENST00000563295 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SEC11AP67812 179 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 KIAA0087Q14695 138 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 C10orf25Q5T742 122 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 ERASQ7Z444 233 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 TIMM17AQ99595 171 aa6.21□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 A0A1W2PNN7 141 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 LINC01546A6NGU7 62 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 KRTDAPP60985 99 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 Q6ZRP5 223 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.2□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 NUPR1O60356 82 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SCGB1D1O95968 90 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 PRSS2P07478 247 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 HERVK_113P63121 156 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 PMCHL1Q16048 86 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.19□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SMIM6P0DI80 62 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 LINC00310P59036 64 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 S100A12P80511 92 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 C2orf82Q6UX34 121 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.18□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 CKS1BP61024 79 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 GAGE2EQ4V326 116 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 PET117Q6UWS5 81 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.17□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.16□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 H0Y8G0 127 aa6.16□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.16□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 Q8IZM0 81 aa6.16□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.16□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 CST9LQ9H4G1 147 aa6.16□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 C3orf79P0CE67 100 aa6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 PMVKQ15126 192 aa6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
KIFC3-215ENST00000563295 FAM168BA1KXE4 195 aa6.14□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 MT1HL1P0DM35 61 aa6.14□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 REG3GQ6UW15 175 aa6.14□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 LINC01600Q96MT4 127 aa6.14□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.14□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.14□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.13□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 F8VRH5 84 aa6.13□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 CXCL5P42830 114 aa6.13□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 C1orf137Q5JT78 98 aa6.13□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 A0A096LNJ9 63 aa6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 PLNP26678 52 aa6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 C12orf57Q99622 126 aa6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 VAMP8Q9BV40 100 aa6.12□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 H3BRM9 83 aa6.11□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 M0QXV9 152 aa6.11□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 DPM2O94777 84 aa6.11□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.11□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 COX7B2Q8TF08 81 aa6.11□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 IGKCP01834 107 aa6.1□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 SPINK8P0C7L1 97 aa6.1□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 HERVK_113P61574 105 aa6.1□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 PYY3Q5JQD4 70 aa6.1□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 LINC01545Q5VT33 79 aa6.1□□□□□ -1.43
KIFC3-215ENST00000563295 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.1□□□□□ -1.43
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