RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GVY2	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	S100A6	P06703	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	WFDC2	Q14508	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	PKD1	P98161	4303 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0J9YXV3	536 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	LECT2	O14960	151 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	FABP4	P15090	132 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312		F8VRH5	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	COX6A2	Q02221	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312		F8WDY8	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312		H3BRM9	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	PLN	P26678	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	S100A2	P29034	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312		H0Y8G0	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	DPM2	O94777	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312		Q8IZM0	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C20orf202	A1L168	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFA1	O15239	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CXCL5	P42830	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	AKR1D1	P51857	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	IGKC	P01834	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	KRTDAP	P60985	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	CKS1B	P61024	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	HERVK_113	P61574	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZRU5	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	C12orf57	Q99622	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	S100A12	P80511	92 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZSA8	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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