RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-215	ENST00000557428	FGF6	P10767	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	ESD	P10768	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428		Q8N8P6	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428		K7EMI3	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	UBE2D1	P51668	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCNX1-215	ENST00000557428	XCL1	P47992	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	VAMP3	Q15836	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TRGC2	P03986	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	HERV-K104	P63124	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	SS18	Q15532	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428		A0A1W2PNN7	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CCL25	O15444	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TSPAN13	O95857	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	FOXI1	Q12951	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428		H0Y9J4	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	MAL	P21145	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428		Q6ZN92	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428		Q6ZUT4	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428		A0A087WZ39	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	NDUFA6	P56556	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CKS1B	P61024	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428		B5MCH6	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	HBD	P02042	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCNX1-215	ENST00000557428	COX7A2L	O14548	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	HSBP1	O75506	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	APOM	O95445	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	AMELX	Q99217	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCNX1-215	ENST00000557428	ATP5L	O75964	103 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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