RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553894.6

RPS6KL1-205, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, human

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 1,626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KL1-205	ENST00000553894	VAMP8	Q9BV40	100 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SLPI	P03973	132 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C2orf82	Q6UX34	121 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NMU	P48645	174 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894		Q6ZRU5	148 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CARD19	Q96LW7	228 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HERV-K104	P63124	156 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	S100A12	P80511	92 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	RNF151	Q2KHN1	245 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C10orf25	Q5T742	122 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PKD1	P98161	4303 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SPATA45	Q537H7	98 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ZNF815P	A8K554	130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LINC00587	B1AMM8	73 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	KRTAP10-2	P60368	255 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PCP2	Q8IVA1	136 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894		A0A1B0GVY2	172 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	COX17	Q14061	63 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	COX8A	P10176	69 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ERG28	Q9UKR5	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894		A0A0J9YXY3	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DLEU1	O43261	78 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C14orf144	Q96I85	54 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PFN2	P35080	140 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	GCSH	P23434	173 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LINC00158	P58513	81 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C12orf57	Q99622	126 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SMIM13	P0DJ93	91 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TIMM17B	O60830	172 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LINC01620	Q4KN68	170 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894		Q6ZRP5	223 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894		A0A0U1RRA0	63 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C16orf90	A8MZG2	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PKHD1	P08F94	4074 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TMEM238	C9JI98	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	GAGE2E	Q4V326	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LITAF	Q99732	161 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894		A0A096LNI7	61 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894		Q6ZVH6	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HIGD1B	Q9P298	99 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DAND5	Q8N907	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DPH3	Q96FX2	82 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PRO1933	Q9H354	126 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SPANXC	Q9NY87	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	COPS9	Q8WXC6	57 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CHTF8	P0CG12	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24

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