RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KLK12Q9UKR0 248 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 F8P00451 2351 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 SYCNQ0VAF6 134 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N9L7 120 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRB-210ENST00000551525 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0087Q14695 138 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YWU9 116 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 EXPH5Q8NEV8 1989 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 MED12LQ86YW9 2145 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB4AO15263 64 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRB-210ENST00000551525 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00313P59037 77 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 CNFNQ9BYD5 112 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01546A6NGU7 62 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 SLPIP03973 132 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 M0R2N4 97 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 PATE2Q6UY27 113 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 X6R8D5 127 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZTI0 123 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01600Q96MT4 127 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 OXTP01178 125 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZQY7 126 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 JMJD1CQ15652 2540 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 EPM2AB3EWF7 344 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 H3BPC8 53 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 HTTP42858 3142 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 H0Y9P7 68 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 REG3GQ6UW15 175 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV2-14P01704 120 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRB-210ENST00000551525 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV4-1P06312 121 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 COX7BP24311 80 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 KLLNB2CW77 178 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 TNCP24821 2201 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 Q75L30 129 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRB-210ENST00000551525 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.44□□□□□ -1.7
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