RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BOP23527 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BBP33778 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BDP58876 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BCP62807 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 SEC11AP67812 179 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 PMVKQ15126 192 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A0J9YXV3 536 aa9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 Q6ZRP5 223 aa9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A1W2PNN7 141 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 NUPR1O60356 82 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HSBP1O75506 76 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 APOMO95445 188 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HERVK_113P63121 156 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP10-8P60410 259 aa9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 REG3GQ6UW15 175 aa9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 C2orf48Q96LS8 159 aa9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.66□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 F8WDY8 70 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLC3P0DOY3 106 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 SPAG11BQ08648 103 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA0087Q14695 138 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.64□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 RNF213Q63HN8 5207 aa9.62□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.62□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.62□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 LEPROTL1O95214 131 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 RNF151Q2KHN1 245 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 NDUFA6P56556 154 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 Q8IZM0 81 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 C11orf86A6NJI1 115 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 NDUFA1O15239 70 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 C10orf25Q5T742 122 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 F8VRH5 84 aa9.57□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 C1orf137Q5JT78 98 aa9.57□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.57□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM168BA1KXE4 195 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 H3BRM9 83 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.55□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 SPINK8P0C7L1 97 aa9.55□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 FABP4P15090 132 aa9.55□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 C2orf82Q6UX34 121 aa9.55□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 PRSS2P07478 247 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 CXCL5P42830 114 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE2EQ4V326 116 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 COX7B2Q8TF08 81 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 IGLV7-43P04211 117 aa9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.52□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM223A0PJW6 202 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 PLNP26678 52 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 CKS1BP61024 79 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 H0Y8G0 127 aa9.49□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.49□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.49□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 DIRC1Q969H9 104 aa9.49□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.48□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 H0Y9J4 135 aa9.48□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 DPM2O94777 84 aa9.48□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC01545Q5VT33 79 aa9.48□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 LPAP08519 4548 aa9.48□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 M0QXV9 152 aa9.47□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 PET117Q6UWS5 81 aa9.47□□□□□ -0.89
KCNQ1-206ENST00000526095 C3orf79P0CE67 100 aa9.46□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.46□□□□□ -0.9
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms