RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518413.2

TMPRSS4-204, Transcript of transmembrane serine protease 4, human

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 700 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LITAF	Q99732	161 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LY6G6C	O95867	125 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PRSS2	P07478	247 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CTAG1A	P78358	180 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00587	B1AMM8	73 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TIMM17B	O60830	172 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C6orf223	Q8N319	242 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMPRSS4-204	ENST00000518413	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413		F8WDY8	70 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413		M0R2N4	97 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TAL2	Q16559	108 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CKS1B	P61024	79 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	WFDC2	Q14508	124 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TMEM238	C9JI98	176 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	HSD52	Q0P140	79 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SPANXC	Q9NY87	97 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	KMT2A	Q03164	3969 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SLPI	P03973	132 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TNP2	Q05952	138 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q6ZVH6	145 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PSCA	O43653	123 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q6ZRU5	148 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LCE6A	A0A183	80 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	COX17	Q14061	63 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CEND1	Q8N111	149 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LECT2	O14960	151 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A0U1RRA0	63 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413		M0R143	59 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	IFITM1	P13164	125 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	FXYD2	P54710	66 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00158	P58513	81 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DAND5	Q8N907	189 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	EREG	O14944	169 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	GCSH	P23434	173 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	PFN2	P35080	140 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A087WTM6	91 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	DNAH2	Q9P225	4427 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RYR2	Q92736	4967 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A0A1B0GWB2	263 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RTL8C	O15255	209 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413		Q8N814	137 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TMPRSS4-204	ENST00000518413		A4D1N5	150 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	NPC2	P61916	151 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	COPS9	Q8WXC6	57 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMPRSS4-204	ENST00000518413	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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