RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 UQCRQO14949 82 aa12.36□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.36□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.36□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 MT-ATP8P03928 68 aa12.36□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 IMUPQ9GZP8 106 aa12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 CENPFP49454 3210 aa12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 REG3GQ6UW15 175 aa12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 C10orf25Q5T742 122 aa12.35□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.34□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFC2O95298 119 aa12.34□□□□□ -0.43
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.33□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.33□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A096LNJ9 63 aa12.32□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.31□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N814 137 aa12.3□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 EPG5Q9HCE0 2579 aa12.3□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 HRCT1Q6UXD1 115 aa12.3□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa12.29□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM19A4Q96LR4 140 aa12.28□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 WFDC13Q8IUB5 93 aa12.28□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6JHZ5 121 aa12.27□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 POLQO75417 2590 aa12.27□□□□□ -0.44
PTDSS1-202ENST00000517309 PRYO14603 147 aa12.27□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 AGRNO00468 2067 aa12.27□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 C1orf137Q5JT78 98 aa12.26□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.26□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFC1O43677 76 aa12.25□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 FSHBP01225 129 aa12.25□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.25□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 CELA1Q9UNI1 258 aa12.25□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 H3BNG1 76 aa12.24□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.24□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM236CP0DP71 79 aa12.24□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.24□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.24□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 SERP2Q8N6R1 65 aa12.23□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.23□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 ACANP16112 2415 aa12.23□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZRU5 148 aa12.22□□□□□ -0.45
PTDSS1-202ENST00000517309 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 KLK9Q2XQG4 91 aa12.2□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00315P59091 139 aa12.2□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01546A6NGU7 62 aa12.18□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.18□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N9L7 120 aa12.18□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.18□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa12.17□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WYN8 130 aa12.17□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 X6R8D5 127 aa12.17□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9BRP9 147 aa12.17□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ESRGQ1W209 222 aa12.16□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 MDFIQ99750 246 aa12.16□□□□□ -0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPRBP23467 1997 aa12.14□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00575Q6W349 94 aa12.13□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 V9GYY9 64 aa12.12□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR15LQ9BU68 103 aa12.12□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 K7ERS5 55 aa12.12□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.11□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 C22orf24Q9Y442 160 aa12.11□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 F8P00451 2351 aa12.11□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 COX7CP15954 63 aa12.1□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6Q795 121 aa12.1□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 XGP55808 180 aa12.1□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.08□□□□□ -0.47
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.07□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 SNURFQ9Y675 71 aa12.07□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WSZ3 146 aa12.06□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8NAQ8 132 aa12.06□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 SPTSSBQ8NFR3 76 aa12.06□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 PCSK5Q92824 1860 aa12.05□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV7A0A075B6U4 112 aa12.05□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.05□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 LIMD2Q9BT23 127 aa12.05□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 SMCR5Q8TEV8 140 aa12.04□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 PRLHP81277 87 aa12.04□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.04□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 SERP1Q9Y6X1 66 aa12.04□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.03□□□□□ -0.48
PTDSS1-202ENST00000517309 BRK1Q8WUW1 75 aa12.02□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 C6orf48Q9UBA6 75 aa12.01□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 MUC4Q99102 2169 aa11.99□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 A8MTW9 85 aa11.99□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZVQ6 151 aa11.99□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00208Q96KT6 92 aa11.99□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00167Q96N53 147 aa11.99□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.98□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N3U1 123 aa11.98□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.97□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR4Q16378 134 aa11.97□□□□□ -0.49
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A096LNT2 108 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.4 ms