RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 GTSF1Q8WW33 167 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 PMCHP20382 165 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 MRAP2Q96G30 205 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 HIGD1CA8MV81 97 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 MT-ND6P03923 174 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 KRTDAPP60985 99 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0U1RRA0 63 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 F5H697 171 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 GATD1Q8NB37 220 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 BATFQ16520 125 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 LRP2P98164 4655 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PNN7 141 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 MTURNQ8N3F0 131 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 DPH3Q96FX2 82 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 COX7A2LO14548 114 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 TSHBP01222 138 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GXF2 115 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 ATOH7Q8N100 152 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-210ENST00000503258 A8MWL6 223 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 C3orf79P0CE67 100 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 PMCHL1Q16048 86 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF861PO60384 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 HSBP1O75506 76 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 HBBP68871 147 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 VAMP8Q9BV40 100 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf137Q5JT78 98 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 C20orf78Q9BR46 151 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 MGPP08493 103 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2D1P51668 147 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 BORCS7Q96B45 105 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 VCYO14598 125 aa4.56□□□□□ -1.68
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PDE4D-210ENST00000503258 VAMP3Q15836 100 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA45Q537H7 98 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 SIGMAR1Q99720 223 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 ST20Q9HBF5 79 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-210ENST00000503258 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 B5MCH6 92 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GUT8 65 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.54□□□□□ -1.68
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PDE4D-210ENST00000503258 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 K7EMI3 77 aa4.53□□□□□ -1.68
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PDE4D-210ENST00000503258 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZVH6 145 aa4.53□□□□□ -1.68
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PDE4D-210ENST00000503258 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-210ENST00000503258 BCE1O60756 84 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 MALP21145 153 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 SPAG11BQ08648 103 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 RIGQ13278 110 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0087Q14695 138 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZN92 141 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.52□□□□□ -1.69
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