RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495259.1

CENPF-205, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 3

Gene CENPF, Length 345 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-205ENST00000495259 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.66□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 Q6ZRU5 148 aa8.66□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 CARD19Q96LW7 228 aa8.66□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.65□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 RNF151Q2KHN1 245 aa8.65□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 LINC01620Q4KN68 170 aa8.65□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 C2orf82Q6UX34 121 aa8.65□□□□□ -1.02
CENPF-205ENST00000495259 J3QL48 77 aa8.64□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 CXCL5P42830 114 aa8.64□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 HERVK_113P61574 105 aa8.64□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 C10orf25Q5T742 122 aa8.64□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.64□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 KRTAP10-1P60331 282 aa8.63□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.62□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 LEPROTO15243 131 aa8.62□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 STPG4Q8N801 248 aa8.62□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.62□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.62□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 SCGB1D1O95968 90 aa8.61□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.61□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 PKHD1P08F94 4074 aa8.6□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 E9PLD3 99 aa8.6□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 SFTA2Q6UW10 78 aa8.6□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 ATOH7Q8N100 152 aa8.6□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.59□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 J3QQQ9 107 aa8.59□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CENPF-205ENST00000495259 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.58□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.58□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.57□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 DPH3Q96FX2 82 aa8.57□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.57□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.57□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.56□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 NMUP48645 174 aa8.56□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.56□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 HERV-K104P63124 156 aa8.56□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 GAGE2BQ13066 116 aa8.55□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 Q6ZSA8 131 aa8.55□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.55□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 A0A096LNI7 61 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 PTTG1IPP53801 180 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 COX17Q14061 63 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 Q6ZRP5 223 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 ERG28Q9UKR5 140 aa8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 LINC00587B1AMM8 73 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 PANO1I0J062 215 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 CHTF8P0CG12 524 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 PFN2P35080 140 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 MAJINQ3KP22 176 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 GAGE2EQ4V326 116 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.53□□□□□ -1.04
CENPF-205ENST00000495259 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.52□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 CDK2AP2O75956 126 aa8.51□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 XGP55808 180 aa8.51□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 LINC00158P58513 81 aa8.51□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 SMIM13P0DJ93 91 aa8.5□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.5□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 A0A087WYN8 130 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 A0A0J9YXY3 114 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 ZNF815PA8K554 130 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 PYY3Q5JQD4 70 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.49□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 A0A0U1RRA0 63 aa8.48□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 SCXQ7RTU7 201 aa8.48□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 PCP2Q8IVA1 136 aa8.48□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.48□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 A0A1W2PNN7 141 aa8.47□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.47□□□□□ -1.05
CENPF-205ENST00000495259 EPM2AB3EWF7 344 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 HAMPP81172 84 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 VAMP8Q9BV40 100 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.45□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.45□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 FAM168BA1KXE4 195 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 TIMM17BO60830 172 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 SPATA45Q537H7 98 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.43□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.43□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CENPF-205ENST00000495259 COX8AP10176 69 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms