RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 SYCNQ0VAF6 134 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 RNF151Q2KHN1 245 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 RYR2Q92736 4967 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 CARD19Q96LW7 228 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 VAMP8Q9BV40 100 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 LINC00587B1AMM8 73 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 S100A12P80511 92 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 COX17Q14061 63 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZRU5 148 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 SLPIP03973 132 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 C2orf82Q6UX34 121 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 A0A1B0GVY2 172 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 MAJINQ3KP22 176 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 SPATA45Q537H7 98 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 ZNF815PA8K554 130 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 DLEU1O43261 78 aa8.44□□□□□ -1.06
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NISCH-208ENST00000481211 C10orf25Q5T742 122 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 ERG28Q9UKR5 140 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 TIMM17BO60830 172 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 GCSHP23434 173 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-2P60368 255 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 PCP2Q8IVA1 136 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 A0A0J9YXY3 114 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 C16orf90A8MZG2 172 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 TMEM238C9JI98 176 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-208ENST00000481211 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZVH6 145 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 COPS9Q8WXC6 57 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.39□□□□□ -1.07
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NISCH-208ENST00000481211 LINC00158P58513 81 aa8.38□□□□□ -1.07
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NISCH-208ENST00000481211 C12orf57Q99622 126 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 RYR3Q15413 4870 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 SMIM13P0DJ93 91 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 PTTG1IPP53801 180 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZRP5 223 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 C14orf144Q96I85 54 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 HIGD1BQ9P298 99 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 SPANXCQ9NY87 97 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 GAGE2BQ13066 116 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 LITAFQ99732 161 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 A0A096LNI7 61 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 IFITM1P13164 125 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 GAGE2EQ4V326 116 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-208ENST00000481211 PKD1P98161 4303 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 TSTD3H0UI37 97 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 LINC01620Q4KN68 170 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZSA8 131 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 A0A0U1RRA0 63 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-1P60331 282 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
NISCH-208ENST00000481211 TAL2Q16559 108 aa8.31□□□□□ -1.08
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