RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A1B0GUV1	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204		H3BRM9	83 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204		K7ERJ3	54 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	CCL25	O15444	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	XCL1	P47992	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-204	ENST00000481204	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A0J9YXY3	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		H3BNG1	76 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SEC11A	P67812	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	REG3A	Q06141	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	CEND1	Q8N111	149 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A0U1RRA0	63 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	NPC2	P61916	151 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SS18	Q15532	418 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	LITAF	Q99732	161 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		Q9H8V8	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	IGLL5	B9A064	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	NDUFA1	O15239	70 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	TAL2	Q16559	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	DAND5	Q8N907	189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A087WZ39	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		A6NDN8	102 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		H3BUT2	72 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	COX7A2L	O14548	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	APOM	O95445	188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	PRSS2	P07478	247 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	MIA	Q16674	131 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A1B0GWB2	263 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	CRP	P02741	224 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	CFC1	P0CG37	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		Q9HAA7	133 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-204	ENST00000481204		F8WDY8	70 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	TIMM17B	O60830	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	PFN2	P35080	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC00158	P58513	81 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	VAMP3	Q15836	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204		Q8IZM0	81 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204		H7C2G1	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	TSPAN13	O95857	204 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	CCL18	P55774	89 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	HERV-K104	P63124	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-204	ENST00000481204	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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