RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466635.1

SYP-203, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-203ENST00000466635 TMEM223A0PJW6 202 aa8.69□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 C20orf202A1L168 122 aa8.69□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 C5orf52A6NGY3 159 aa8.69□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 RNF151Q2KHN1 245 aa8.69□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 LINC01545Q5VT33 79 aa8.68□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 C2orf82Q6UX34 121 aa8.68□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.68□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.68□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.67□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 AKR1D1P51857 326 aa8.67□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 HERVK_113P61574 105 aa8.67□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.67□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.66□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 C10orf25Q5T742 122 aa8.66□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 SFTA2Q6UW10 78 aa8.65□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.65□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SYP-203ENST00000466635 PKHD1P08F94 4074 aa8.65□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 DPH3Q96FX2 82 aa8.64□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.64□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 CDK2AP2O75956 126 aa8.63□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 Q6ZSA8 131 aa8.63□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.63□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.62□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 LEPROTO15243 131 aa8.62□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 GAGE2BQ13066 116 aa8.62□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.62□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.61□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.61□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.61□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 A0A096LNI7 61 aa8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 E9PLD3 99 aa8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 PTTG1IPP53801 180 aa8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 MAJINQ3KP22 176 aa8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 J3QQQ9 107 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 CHTF8P0CG12 524 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 HERV-K104P63124 156 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 STPG4Q8N801 248 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.59□□□□□ -1.03
SYP-203ENST00000466635 SCGB1D1O95968 90 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 NMUP48645 174 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 XGP55808 180 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 GAGE2EQ4V326 116 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 Q6ZRP5 223 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 ATOH7Q8N100 152 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 LINC00587B1AMM8 73 aa8.57□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 PANO1I0J062 215 aa8.57□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 COX17Q14061 63 aa8.57□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 SCXQ7RTU7 201 aa8.57□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 ERG28Q9UKR5 140 aa8.57□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 PFN2P35080 140 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 HAMPP81172 84 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 A0A087WYN8 130 aa8.55□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.55□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.55□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 LINC00158P58513 81 aa8.54□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.54□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 HERC2O95714 4834 aa8.52□□□□□ -1.04
SYP-203ENST00000466635 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.52□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.51□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 A0A0U1RRA0 63 aa8.51□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 SMIM13P0DJ93 91 aa8.51□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.51□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 A0A1W2PNN7 141 aa8.5□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 ZNF815PA8K554 130 aa8.5□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.49□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 RYR1P21817 5038 aa8.49□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.49□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 A0A0J9YXY3 114 aa8.48□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 FAM168BA1KXE4 195 aa8.48□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 FAM229AH3BQW9 127 aa8.48□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.48□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 C7orf33Q8WU49 177 aa8.48□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 EPM2AB3EWF7 344 aa8.47□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.47□□□□□ -1.05
SYP-203ENST00000466635 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.46□□□□□ -1.06
SYP-203ENST00000466635 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.46□□□□□ -1.06
SYP-203ENST00000466635 Q8N1X5 172 aa8.46□□□□□ -1.06
SYP-203ENST00000466635 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.46□□□□□ -1.06
SYP-203ENST00000466635 M0QXV9 152 aa8.45□□□□□ -1.06
SYP-203ENST00000466635 TIMM17BO60830 172 aa8.45□□□□□ -1.06
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