RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 C10orf25Q5T742 122 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-204ENST00000464280 Q8IZM0 81 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-204ENST00000464280 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-204ENST00000464280 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-204ENST00000464280 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-204ENST00000464280 A0A096LNJ9 63 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 ATP5LO75964 103 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 GHRHP01286 108 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 C2orf82Q6UX34 121 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 MYCBP2O75592 4640 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 PMCHL1Q16048 86 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 H3BRM9 83 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 CXCL5P42830 114 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 NDUFA6P56556 154 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 Q6ZRP5 223 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 TRGC2P03986 189 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 IGLC3P0DOY3 106 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 A0A1W2PNN7 141 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 F8VRH5 84 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 J3QL48 77 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 GAGE2EQ4V326 116 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 BAGE3Q86Y29 109 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 COX7B2Q8TF08 81 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 HSBP1O75506 76 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 OXTP01178 125 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 SPINK8P0C7L1 97 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-204ENST00000464280 COLCA2A8K830 154 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 FAM168BA1KXE4 195 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 C11orf86A6NJI1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 M0QXV9 152 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 SERF1AO75920 110 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 LEPROTL1O95214 131 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 SFTA2Q6UW10 78 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-204ENST00000464280 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 UBE2BP63146 152 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 C1orf137Q5JT78 98 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 SCO1O75880 301 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 LINC00310P59036 64 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 COX17Q14061 63 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 REG3GQ6UW15 175 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 TMEM223A0PJW6 202 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 H0Y8G0 127 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 C22orf24Q9Y442 160 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 NUPR1O60356 82 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 FABP4P15090 132 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 PFN2P35080 140 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 ERG28Q9UKR5 140 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 IGLV7-43P04211 117 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BKO60814 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BJP06899 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BOP23527 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 PLNP26678 52 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BBP33778 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BDP58876 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BCP62807 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 LINC01600Q96MT4 127 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-204ENST00000464280 HERC1Q15751 4861 aa7.15□□□□□ -1.27
NISCH-204ENST00000464280 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.14□□□□□ -1.27
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