RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD19Q96LW7 228 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00587B1AMM8 73 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF151Q2KHN1 245 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf82Q6UX34 121 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZRU5 148 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RYR2Q92736 4967 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 SLPIP03973 132 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA45Q537H7 98 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF815PA8K554 130 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf25Q5T742 122 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH2Q9P225 4427 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 COX17Q14061 63 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 COX8AP10176 69 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-2P60368 255 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PCP2Q8IVA1 136 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 ERG28Q9UKR5 140 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0J9YXY3 114 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GVY2 172 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DLEU1O43261 78 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GCSHP23434 173 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00158P58513 81 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TIMM17BO60830 172 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PFN2P35080 140 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf144Q96I85 54 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C12orf57Q99622 126 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM13P0DJ93 91 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 23.7
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0U1RRA0 63 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf90A8MZG2 172 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM238C9JI98 176 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2BQ13066 116 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01620Q4KN68 170 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZRP5 223 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PTTG1IPP53801 180 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2EQ4V326 116 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZVH6 145 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 COPS9Q8WXC6 57 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 RYR3Q15413 4870 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LITAFQ99732 161 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 HIGD1BQ9P298 99 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A096LNI7 61 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TSTD3H0UI37 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IFITM1P13164 125 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 DPH3Q96FX2 82 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXCQ9NY87 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-1P60331 282 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 DAND5Q8N907 189 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 PRO1933Q9H354 126 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 XAGE1AQ9HD64 81 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H4GQ99525 98 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 CHTF8P0CG12 524 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms