RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 SLPIP03973 132 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 VAMP8Q9BV40 100 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 A0A0J9YXV3 536 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 H0Y8G0 127 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 CHTF8P0CG12 524 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 SS18Q15532 418 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 E9PLD3 99 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 DLEU1O43261 78 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 FOXI1Q12951 378 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 hDV102S1A0JD36 115 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM223A0PJW6 202 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 XCL1P47992 114 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087WZ39 114 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 H3BRM9 83 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 COX6A2Q02221 97 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 ATOH7Q8N100 152 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 STPG4Q8N801 248 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 HERVK_113P61574 105 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 MAJINQ3KP22 176 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 C14orf177Q52M58 125 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 SPATA45Q537H7 98 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 LEPROTO15243 131 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 COX8AP10176 69 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 TSTD3H0UI37 97 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-216ENST00000428482 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 J3QQQ9 107 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 NMUP48645 174 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 SFTA2Q6UW10 78 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 A0A096LNI7 61 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 F8WDY8 70 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 COX7A2LO14548 114 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 C14orf144Q96I85 54 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 HIGD1BQ9P298 99 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 FAM229AH3BQW9 127 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 APOMO95445 188 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 C5orf38Q86SI9 138 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 PCP2Q8IVA1 136 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 Q8IZM0 81 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 CARD19Q96LW7 228 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087WYN8 130 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFA1O15239 70 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 SPINK8P0C7L1 97 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 DDTP30046 118 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 HERV-K104P63124 156 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 KIAA0087Q14695 138 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 CFAP161Q6P656 301 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZRU5 148 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 PRO1933Q9H354 126 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM17BO60830 172 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 CXCL5P42830 114 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 SPAG11BQ08648 103 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 TAL2Q16559 108 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 COX7B2Q8TF08 81 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 PTTG1IPP53801 180 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.45□□□□□ -1.38
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