RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 RYR1P21817 5038 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 C11orf86A6NJI1 115 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 SPINK8P0C7L1 97 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 FABP4P15090 132 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 C10orf25Q5T742 122 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 COX7B2Q8TF08 81 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 A0A096LNI7 61 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 PANO1I0J062 215 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 PTTG1IPP53801 180 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 ODF1Q14990 250 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 C2orf82Q6UX34 121 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 FAM229AH3BQW9 127 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 CHTF8P0CG12 524 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 HAMPP81172 84 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 GAGE2BQ13066 116 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 MAJINQ3KP22 176 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 A0A087WYN8 130 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 PLNP26678 52 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 SFTA2Q6UW10 78 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 HSPG2P98160 4391 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 HERC2O95714 4834 aa8.21□□□□□ -1.09
HDLBP-210ENST00000423693 EPM2AB3EWF7 344 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 H0Y8G0 127 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM223A0PJW6 202 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 STPG4Q8N801 248 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 DPM2O94777 84 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 Q5VSD8 79 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZRP5 223 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.19□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 PET117Q6UWS5 81 aa8.18□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 IGKCP01834 107 aa8.17□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 COX17Q14061 63 aa8.16□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 GAGE2EQ4V326 116 aa8.16□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 LINC01545Q5VT33 79 aa8.16□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.16□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 S100A6P06703 90 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 HERVK_113P61574 105 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 C7orf33Q8WU49 177 aa8.15□□□□□ -1.1
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1W2PNN7 141 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 C3orf79P0CE67 100 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 AKR1D1P51857 326 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.14□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 S100A2P29034 98 aa8.13□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 HERV-K104P63124 156 aa8.13□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 C20orf202A1L168 122 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00587B1AMM8 73 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 LEPROTO15243 131 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 KRTDAPP60985 99 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 ERG28Q9UKR5 140 aa8.12□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 NMUP48645 174 aa8.11□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 PFN2P35080 140 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 FAM168BA1KXE4 195 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 E9PLD3 99 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 J3QQQ9 107 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-210ENST00000423693 FAT1Q14517 4588 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 C5orf52A6NGY3 159 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.07□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 M0QXV9 152 aa8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00158P58513 81 aa8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.05□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 C22orf24Q9Y442 160 aa8.05□□□□□ -1.12
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.04□□□□□ -1.12
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