RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 CHTF8P0CG12 524 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 COX8AP10176 69 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 ERASQ7Z444 233 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM141Q96I45 108 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 LINC01600Q96MT4 127 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 TIMM17AQ99595 171 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.91□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.9□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 DLEU1O43261 78 aa6.9□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 SLPIP03973 132 aa6.9□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 CFAP161Q6P656 301 aa6.9□□□□□ -1.3
SMIM25-201ENST00000421019 H0Y8G0 127 aa6.89□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.89□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.88□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 IGIPA6NJ69 53 aa6.88□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 ODF1Q14990 250 aa6.88□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 BATFQ16520 125 aa6.88□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 VCX2Q9H322 139 aa6.88□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.87□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 CCL25O15444 150 aa6.87□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 DPM2O94777 84 aa6.87□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 COX6A2Q02221 97 aa6.87□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0J9YXV3 536 aa6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 IGKCP01834 107 aa6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 Q6ZUT4 128 aa6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 STPG4Q8N801 248 aa6.86□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 PLNP26678 52 aa6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 SS18Q15532 418 aa6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 REG3GQ6UW15 175 aa6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 C15orf56Q8N910 161 aa6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.85□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP10-8P60410 259 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 SEC11AP67812 179 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 PMVKQ15126 192 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 AMELXQ99217 191 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.84□□□□□ -1.31
SMIM25-201ENST00000421019 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 F8VRH5 84 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 FAM104AQ969W3 186 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 CST9LQ9H4G1 147 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 HIGD1BQ9P298 99 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 LRP2P98164 4655 aa6.83□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.82□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 HSD52Q0P140 79 aa6.82□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 UBE2D1P51668 147 aa6.81□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 A0A096LNI7 61 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 A6NDN8 102 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 NMUP48645 174 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 HERVK_113P63121 156 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 Q6ZRP5 223 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.79□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 XCL1P47992 114 aa6.79□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 H3BRM9 83 aa6.78□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 TAX1BP3O14907 124 aa6.78□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 FOXI1Q12951 378 aa6.78□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 TAL2Q16559 108 aa6.78□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.78□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 PCP2Q8IVA1 136 aa6.78□□□□□ -1.32
SMIM25-201ENST00000421019 COX7A2LO14548 114 aa6.77□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 MALP21145 153 aa6.77□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 HERVK_113P61574 105 aa6.77□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 E9PLD3 99 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 APOMO95445 188 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 UBE2V1Q13404 147 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 CARD19Q96LW7 228 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 TNXBP22105 4242 aa6.76□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 A0A087WZ39 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SMIM25-201ENST00000421019 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms