RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358161.9

SPTAN1-201, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-201ENST00000358161 Q6ZSN1 163 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 NDUFC2O95298 119 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 PRYO14603 147 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 UQCRQO14949 82 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 FSHBP01225 129 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 Q8N814 137 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 IMUPQ9GZP8 106 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 C20orf197Q8N268 126 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 CENPFP49454 3210 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 MT-ATP8P03928 68 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 Q6JHZ5 121 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 C1orf137Q5JT78 98 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 NDUFC1O43677 76 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 CELA1Q9UNI1 258 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.27□□□□□ -1.24
SPTAN1-201ENST00000358161 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00310P59036 64 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 H3BNG1 76 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 MDFIQ99750 246 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 PRR15LQ9BU68 103 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM236CP0DP71 79 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 Q9BRP9 147 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 Q6ZRU5 148 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 K7ERS5 55 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 SERP2Q8N6R1 65 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 Q8N9L7 120 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 A0A087WYN8 130 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 A0A096LNJ9 63 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 ESRGQ1W209 222 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC01546A6NGU7 62 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.21□□□□□ -1.25
SPTAN1-201ENST00000358161 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 V9GYY9 64 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 LIMD2Q9BT23 127 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 X6R8D5 127 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 C22orf24Q9Y442 160 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00575Q6W349 94 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 KLK9Q2XQG4 91 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 Q6ZVQ6 151 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00315P59091 139 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 SNURFQ9Y675 71 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 MUC4Q99102 2169 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 PRLHP81277 87 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 Q8NAQ8 132 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 MTORP42345 2549 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-201ENST00000358161 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 COX7CP15954 63 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 BRK1Q8WUW1 75 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 A0A087WSZ3 146 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 Q6Q795 121 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 XGP55808 180 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 A8MTW9 85 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 ACANP16112 2415 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00167Q96N53 147 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 FAM229AH3BQW9 127 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00208Q96KT6 92 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 RTL8CO15255 209 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-201ENST00000358161 POLQO75417 2590 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-201ENST00000358161 PRR4Q16378 134 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms