RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 CRYGDP07320 174 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 COX7CP15954 63 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 MFAP4P55083 255 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 FXYD7P58549 80 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 TMEM258P61165 79 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 WT1-ASQ06250 92 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 LINC00643Q86TS7 51 aa8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 CGB1A6NKQ9 187 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 SMKR1H3BMG3 65 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-23P01764 117 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 HAMPP81172 84 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.14□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 A0A0J9YX75 114 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R17O96001 155 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 OXTP01178 125 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 EMP1P54849 157 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 ERCC8Q13216 396 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 NRACQ8N912 160 aa8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 ATOX1O00244 68 aa8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 C11orf86A6NJI1 115 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 F5H768 121 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 M0R381 172 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 ORM1P02763 201 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 KLK9Q2XQG4 91 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 C5orf38Q86SI9 138 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 S4R3C0 116 aa8.11□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 RBAKDNA6NC62 111 aa8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 COX6CP09669 75 aa8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 C2orf82Q6UX34 121 aa8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 C8orf49Q96NF6 230 aa8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 LYZP61626 148 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 ZNF56Q15929 161 aa8.09□□□□□ -1.11
HCG18-241ENST00000602290 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.08□□□□□ -1.12
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HCG18-241ENST00000602290 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TMEM141Q96I45 108 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 METTL26Q96S19 204 aa8.08□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.07□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.07□□□□□ -1.12
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HCG18-241ENST00000602290 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.07□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.07□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 C2orf48Q96LS8 159 aa8.07□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.07□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TEX22C9J3V5 150 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 E7EUB6 86 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 DPH3Q96FX2 82 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 H3BTX0 84 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 H7C423 109 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 I3L2K1 104 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 LEPROTO15243 131 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TIMM17AQ99595 171 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 LST1O00453 97 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 DAND5Q8N907 189 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 RNF125Q96EQ8 232 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 AMELXQ99217 191 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 TMEM223A0PJW6 202 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 IGKV1-17P01599 117 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 DEFB131AP59861 70 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 STHQ8IWL8 128 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-241ENST00000602290 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 J3QQQ9 107 aa8.02□□□□□ -1.13
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