RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 A0A096LNI7 61 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 XKRY2A2RUG3 117 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 SMKR1H3BMG3 65 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TEX46H3BTG2 121 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 NCR2O95944 276 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 COX6A2Q02221 97 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 COTL1Q14019 142 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 AKAP14Q86UN6 197 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 NUP35Q8NFH5 326 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 HIGD1CA8MV81 97 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 A8MWL6 223 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 H7C423 109 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 I3L3M4 83 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 PHOX2AO14813 284 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 AMN1Q8IY45 258 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TSKUQ8WUA8 353 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 ISOC2Q96AB3 205 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 BIN3Q9NQY0 253 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 OSTCQ9NRP0 149 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GUT8 65 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 UBE2L6O14933 153 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 CCL25O15444 150 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 APCSP02743 223 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP10-8P60410 259 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZRU5 148 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GXF2 115 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 NDUFAF8A1L188 74 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 ZNF727A8MUV8 499 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 PMCHP20382 165 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 XCL1P47992 114 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 CEBPGP53567 150 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZRP5 223 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 ST20Q9HBF5 79 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 A0A1W2PNN7 141 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 MAJINQ3KP22 176 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 TEX261Q6UWH6 196 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZUT4 128 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 MRAP2Q96G30 205 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 LINC01600Q96MT4 127 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 NPYP01303 97 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.26□□□□□ -1.89
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HERC3-212ENST00000597259 CFAP161Q6P656 301 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.26□□□□□ -1.89
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HERC3-212ENST00000597259 MUC17Q685J3 4493 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 A0A0J9YXV3 536 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 SYCNQ0VAF6 134 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 RIGQ13278 110 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 KIAA0087Q14695 138 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 ADIRFQ15847 76 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 CARD19Q96LW7 228 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 NAT8Q9UHE5 227 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-212ENST00000597259 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.24□□□□□ -1.89
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