RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 NUP35Q8NFH5 326 aa5.05□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 C2orf48Q96LS8 159 aa5.05□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.05□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.05□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PNN7 141 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 LINC00862A6NCI5 91 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 TCAPO15273 167 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 MT-ND6P03923 174 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 ODF1Q14990 250 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 NRACQ8N912 160 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.04□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 CKS2P33552 79 aa5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 RNF151Q2KHN1 245 aa5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 C20orf78Q9BR46 151 aa5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 V9GYV3 84 aa5.03□□□□□ -1.6
COCH-211ENST00000557065 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GW15 77 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 F8WDY8 70 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 SPAG11BQ08648 103 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 IMMP2LQ96T52 175 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.02□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 TNFRSF6BO95407 300 aa5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 C1orf137Q5JT78 98 aa5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 Q6ZUT4 128 aa5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.01□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 A0A087WZ39 114 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 F8W036 122 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 NDUFA1O15239 70 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 S100A8P05109 93 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 ADIRFQ15847 76 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 ORAOV1Q8WV07 137 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 DIRC1Q969H9 104 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 NAT8Q9UHE5 227 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 LRP2P98164 4655 aa5□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 D6R8Y8 96 aa4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 PPBPP02775 128 aa4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 RAB5AP20339 215 aa4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 HBBP68871 147 aa4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 PEA15Q15121 130 aa4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.99□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 IFITM10A6NMD0 228 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 IGLV7-43P04211 117 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 GAGE2EQ4V326 116 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 FAM104AQ969W3 186 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.98□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 C9JQL5 133 aa4.97□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.97□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 C10orf25Q5T742 122 aa4.97□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.97□□□□□ -1.61
COCH-211ENST00000557065 FAM168BA1KXE4 195 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 NPYP01303 97 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 ORMDL3Q8N138 153 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.96□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GXF2 115 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 H0Y9J4 135 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 UBE2BP63146 152 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 KIAA0087Q14695 138 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 PRELID3AQ96N28 172 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 RNF213Q63HN8 5207 aa4.95□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.94□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 LCE4AQ5TA78 99 aa4.94□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.94□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.94□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.94□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 TMEM141Q96I45 108 aa4.94□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.93□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.93□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 PRSS47A8MTI9 375 aa4.93□□□□□ -1.62
COCH-211ENST00000557065 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms