RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-223	ENST00000551137	C7orf33	Q8WU49	177 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-223	ENST00000551137	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137		K7EMI3	77 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	TMEM218	A2RU14	115 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	NPS	P0C0P6	89 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	IFITM2	Q01629	132 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137		Q8N8P6	123 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	IFITM10	A6NMD0	228 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	ADCYAP1	P18509	176 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137		A0A087WZ39	114 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	TMEM141	Q96I45	108 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	SEC11C	Q9BY50	192 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	MT1HL1	P0DM35	61 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	G0S2	P27469	103 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	AMELX	Q99217	191 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	NDUFA1	O15239	70 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	UBE2D1	P51668	147 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	KIAA0087	Q14695	138 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-223	ENST00000551137	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137		Q6ZRP5	223 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PNN7	141 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	COX19	Q49B96	90 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137		Q6ZN92	141 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	VCX2	Q9H322	139 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	LINC01546	A6NGU7	62 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	TIMM17A	Q99595	171 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137		A0A0J9YXV3	536 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	S100P	P25815	95 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	SEC11A	P67812	179 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	LINC01600	Q96MT4	127 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	MT-ND6	P03923	174 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	NDUFA5	Q16718	116 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	ODF1	Q14990	250 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	RHEB	Q15382	184 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CS-223	ENST00000551137	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	HERVK_113	P63121	156 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137		Q8IZM0	81 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	KRTAP10-8	P60410	259 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-223	ENST00000551137	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28

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