RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534645.1

RCE1-208, Transcript of Ras converting CAAX endopeptidase 1, human

TSL 5

Gene RCE1, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCE1-208	ENST00000534645	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	FOXI1	Q12951	378 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	NUPR1	O60356	82 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	HSBP1	O75506	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SERF1A	O75920	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	NDUFA6	P56556	154 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	LINC00310	P59036	64 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645		A0A096LNJ9	63 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	COX7A2L	O14548	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	HBD	P02042	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	MAL	P21145	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	VCX2	Q9H322	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	FAT1	Q14517	4588 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	NPS	P0C0P6	89 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645		Q6ZN92	141 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PANO1	I0J062	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	ATP5L	O75964	103 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SLPI	P03973	132 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	AMELX	Q99217	191 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	APOM	O95445	188 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	FABP4	P15090	132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	COX6A2	Q02221	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RCE1-208	ENST00000534645	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645		A0A087WYN8	130 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645		A0A096LNI7	61 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	S100A6	P06703	90 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	UBE2D1	P51668	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	PMVK	Q15126	192 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645		A0A0J9YXV3	536 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645		Q6ZRU5	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCE1-208	ENST00000534645	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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