RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 ADCYAP1P18509 176 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 GAGE2BQ13066 116 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 PPBPP02775 128 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 IFITM10A6NMD0 228 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 MT-ND4LP03901 98 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 MT1HL1P0DM35 61 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 PTTG1IPP53801 180 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 SPAG11BQ08648 103 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 CLLU1Q5K131 121 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 C7orf33Q8WU49 177 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PNN7 141 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 RAB5AP20339 215 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 C10orf25Q5T742 122 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 PRSS47A8MTI9 375 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 ODF1Q14990 250 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 APOMO95445 188 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 Q8N8P6 123 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 C2orf48Q96LS8 159 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 TMEM218A2RU14 115 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 TMEM141Q96I45 108 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-213ENST00000494956 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 IMMP2LQ96T52 175 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 FAM168BA1KXE4 195 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 H3BS24 57 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 UBE2D1P51668 147 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 KIAA0087Q14695 138 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 C2orf82Q6UX34 121 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 A0A087WZ39 114 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA1O15239 70 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 UQCC3Q6UW78 93 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZRP5 223 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 COMMD7Q86VX2 200 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 AMELXQ99217 191 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 IGIPA6NJ69 53 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 RNF151Q2KHN1 245 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 GAGE2EQ4V326 116 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 SEC11CQ9BY50 192 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 VCX2Q9H322 139 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZN92 141 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 LINC01600Q96MT4 127 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-213ENST00000494956 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 TOMM6Q96B49 74 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 F8WDY8 70 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 MT-ND6P03923 174 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 C1orf137Q5JT78 98 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 K7EMI3 77 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-213ENST00000494956 S100PP25815 95 aa6.5□□□□□ -1.37
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