RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494582.1

LINC00488-201, long intergenic non-protein coding RNA 488, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00488, Length 2,520 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00488-201ENST00000494582 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00488-201ENST00000494582 IGLV1-40P01703 118 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00488-201ENST00000494582 IGHV3-53P01767 116 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00488-201ENST00000494582 LMO4P61968 165 aa7.18□□□□□ -1.26
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LINC00488-201ENST00000494582 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00488-201ENST00000494582 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.17□□□□□ -1.26
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LINC00488-201ENST00000494582 H3BUA1 57 aa7.15□□□□□ -1.26
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LINC00488-201ENST00000494582 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.15□□□□□ -1.26
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LINC00488-201ENST00000494582 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00488-201ENST00000494582 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00488-201ENST00000494582 H3BUX3 64 aa7.13□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00488-201ENST00000494582 AKAP9Q99996 3911 aa7.13□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 ZNF292O60281 2723 aa7.12□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.11□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 DEFB131AP59861 70 aa7.1□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.1□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 KLKP1Q107X0 134 aa7.09□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.09□□□□□ -1.27
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LINC00488-201ENST00000494582 HAMPP81172 84 aa7.03□□□□□ -1.28
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LINC00488-201ENST00000494582 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 SEC61GP60059 68 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 DEFB136Q30KP8 78 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 Q6ZVQ6 151 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 ZNF843Q8N446 348 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 Q8NDZ9 215 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 UBE2L6O14933 153 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 BCE1O60756 84 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 C1orf195Q5TG92 126 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 SLURP1P55000 103 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00488-201ENST00000494582 SCXQ7RTU7 201 aa7.01□□□□□ -1.29
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