RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 TNFRSF6BO95407 300 aa5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 MALP21145 153 aa5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 NAT8Q9UHE5 227 aa5.48□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 LPAP08519 4548 aa5.47□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GXF2 115 aa5.47□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 CKS2P33552 79 aa5.47□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP10-8P60410 259 aa5.47□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 SPAG11BQ08648 103 aa5.47□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.47□□□□□ -1.53
HDAC3-211ENST00000491581 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 KIR2DL4Q99706 377 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.46□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LRP2P98164 4655 aa5.45□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.45□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 APOMO95445 188 aa5.45□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf82Q6UX34 121 aa5.45□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.45□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.44□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.44□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 HBBP68871 147 aa5.44□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.44□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZRP5 223 aa5.44□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 RNF213Q63HN8 5207 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 IFITM10A6NMD0 228 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 PEA15Q15121 130 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE2EQ4V326 116 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C1orf137Q5JT78 98 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C20orf78Q9BR46 151 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.43□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R2P9O14990 202 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 MT-ND6P03923 174 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 KIAA0087Q14695 138 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf48Q96LS8 159 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 PRELID3AQ96N28 172 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.42□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00862A6NCI5 91 aa5.41□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.41□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R17O96001 155 aa5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 REG3GQ6UW15 175 aa5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 ORMDL3Q8N138 153 aa5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
HDAC3-211ENST00000491581 A0A087WZ39 114 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 F8W036 122 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFA1O15239 70 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV7-43P04211 117 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2D1P51668 147 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM18Q96B42 140 aa5.39□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GW15 77 aa5.38□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.38□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.38□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 M0QXV9 152 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 ADCYAP1P18509 176 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 RAB5AP20339 215 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 RNF151Q2KHN1 245 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM141Q96I45 108 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 IMMP2LQ96T52 175 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.37□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 PPBPP02775 128 aa5.36□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.36□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N8P6 123 aa5.36□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.36□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 IGIPA6NJ69 53 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 PRSS47A8MTI9 375 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 S100A8P05109 93 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 AMELXQ99217 191 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.35□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 H0Y9J4 135 aa5.34□□□□□ -1.55
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2BP63146 152 aa5.34□□□□□ -1.55
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