RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 CKS2P33552 79 aa12.69□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 C1orf137Q5JT78 98 aa12.69□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.69□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.68□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 KIR2DL4Q99706 377 aa12.68□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.67□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 D6R8Y8 96 aa12.67□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 ORMDL3Q8N138 153 aa12.67□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 DIRC1Q969H9 104 aa12.67□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.67□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 TNFRSF6BO95407 300 aa12.66□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 RHEBQ15382 184 aa12.66□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.66□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 A0A0U1RQV1 116 aa12.65□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 APOMO95445 188 aa12.65□□□□□ -0.38
NELFE-210ENST00000491139 MALP21145 153 aa12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 FCER1GP30273 86 aa12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 NPYP01303 97 aa12.63□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 PRSS47A8MTI9 375 aa12.62□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 IGLV7-43P04211 117 aa12.62□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 COX7A2LO14548 114 aa12.61□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 PRR4Q16378 134 aa12.61□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.61□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 PRELID3AQ96N28 172 aa12.61□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.61□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.6□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 TMEM18Q96B42 140 aa12.6□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 C1orf196B1AJZ1 125 aa12.59□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 H0Y9J4 135 aa12.59□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 S100PP25815 95 aa12.59□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 C2orf48Q96LS8 159 aa12.59□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.59□□□□□ -0.39
NELFE-210ENST00000491139 A0A087WZ39 114 aa12.58□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 COX19Q49B96 90 aa12.57□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 K7EMI3 77 aa12.56□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.56□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.56□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 NDUFA5Q16718 116 aa12.55□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 SVBPQ8N300 66 aa12.55□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 RNF151Q2KHN1 245 aa12.54□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.54□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 UBE2D1P51668 147 aa12.53□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 C5orf38Q86SI9 138 aa12.53□□□□□ -0.4
NELFE-210ENST00000491139 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 SNAPINO95295 136 aa12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 SPAG11BQ08648 103 aa12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 Q8N8P6 123 aa12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.52□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 RAB5AP20339 215 aa12.51□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 Q6ZUT4 128 aa12.51□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.51□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 APOC3P02656 99 aa12.5□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.5□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 FAM168BA1KXE4 195 aa12.49□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 NPSP0C0P6 89 aa12.48□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.48□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 OR10D4PQ8NGN7 298 aa12.48□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 FAM104AQ969W3 186 aa12.47□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa12.46□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NELFE-210ENST00000491139 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa12.45□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 F8WDY8 70 aa12.45□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.45□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 LINC01546A6NGU7 62 aa12.44□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 NDUFA1O15239 70 aa12.44□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 G0S2P27469 103 aa12.44□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 ORAOV1Q8WV07 137 aa12.44□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 TLX1NBP0CAT3 122 aa12.43□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 UBE2BP63146 152 aa12.43□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 FAT4Q6V0I7 4981 aa12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 GAGE2EQ4V326 116 aa12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.42□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 C10orf25Q5T742 122 aa12.41□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.4□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 LINC01549A6NIU2 74 aa12.4□□□□□ -0.42
NELFE-210ENST00000491139 IFITM10A6NMD0 228 aa12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms