RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 ORMDL3Q8N138 153 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 ST20Q9HBF5 79 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 ATP6V1G1O75348 118 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 D6R8Y8 96 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 MALP21145 153 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 C20orf78Q9BR46 151 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-217ENST00000489650 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 PRELID3AQ96N28 172 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-217ENST00000489650 VCYO14598 125 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 TCAPO15273 167 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 C1orf137Q5JT78 98 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRN-217ENST00000489650 SMKR1H3BMG3 65 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 COX7A2LO14548 114 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 TNFRSF6BO95407 300 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 APOMO95445 188 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 C5orf38Q86SI9 138 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 KIR2DL4Q99706 377 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 NRACQ8N912 160 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 YPEL4Q96NS1 127 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 FCER1GP30273 86 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 C2orf48Q96LS8 159 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 NPYP01303 97 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 RAB5AP20339 215 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 PRSS47A8MTI9 375 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRN-217ENST00000489650 COLCA2A8K830 154 aa11.2□□□□□ -0.62
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PTPRN-217ENST00000489650 IGLV7-43P04211 117 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 SPAG11BQ08648 103 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM18Q96B42 140 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 FAM168BA1KXE4 195 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 K7EMI3 77 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 G0S2P27469 103 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 Q6ZUT4 128 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WZ39 114 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 Q8N8P6 123 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 DIRC1Q969H9 104 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 RNF151Q2KHN1 245 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 RAB5BP61020 215 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 H0Y9J4 135 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 TRGC2P03986 189 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 C10orf25Q5T742 122 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 FA2HQ7L5A8 372 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-217ENST00000489650 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 LINC01549A6NIU2 74 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 MUC2Q02817 5179 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 GAGE2EQ4V326 116 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 FAM104AQ969W3 186 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFA1O15239 70 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 PRR4Q16378 134 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00614P0C842 121 aa11.09□□□□□ -0.63
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