RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RRM2-208	ENST00000487591	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RRM2-208	ENST00000487591	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591		M0QXV9	152 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF861P	O60384	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	MRAP2	Q96G30	205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	GNG13	Q9P2W3	67 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	UBE2B	P63146	152 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	KIAA0087	Q14695	138 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	GNG4	P50150	75 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		5	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	NDUFA1	O15239	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	RAB4A	P20338	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	NRAC	Q8N912	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2-208	ENST00000487591	CRYGA	P11844	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591		F8WDY8	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	VCY	O14598	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	FCER1G	P30273	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF345	Q14585	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	PDE6D	O43924	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	NUPR1	O60356	82 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	BCE1	O60756	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM2-208	ENST00000487591		A0A1B0GUT8	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	MT1H	P80294	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591		A8MWL6	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	SCO1	O75880	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	TCAP	O15273	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	HBB	P68871	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM2-208	ENST00000487591	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.9 ms