RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 MALP21145 153 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 C5orf38Q86SI9 138 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 TRGC2P03986 189 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 COX6A2Q02221 97 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 SPACA4Q8TDM5 124 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 IFITM10A6NMD0 228 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 NPSP0C0P6 89 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 TMEM141Q96I45 108 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 IGIPA6NJ69 53 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 CHTF8P0CG12 524 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 LINC01546A6NGU7 62 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 APOMO95445 188 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 SYCNQ0VAF6 134 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 CARD19Q96LW7 228 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 AMELXQ99217 191 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 MYCBP2O75592 4640 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-209ENST00000485765 A0A087WYN8 130 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 G0S2P27469 103 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 RAB5BP61020 215 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 C2orf48Q96LS8 159 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 TEX43Q6ZNM6 134 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 OR10D4PQ8NGN7 298 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 TOMM6Q96B49 74 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 DPH3Q96FX2 82 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 UBE2D1P51668 147 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZRU5 148 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 PKIGQ9Y2B9 76 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 A0A087WZ39 114 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 VCX2Q9H322 139 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 A0A096LNI7 61 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 F8WDY8 70 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZN92 141 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 FA2HQ7L5A8 372 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 TIMM17AQ99595 171 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 SPAG11BQ08648 103 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 MAJINQ3KP22 176 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 BAGE3Q86Y29 109 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 C2orf88Q9BSF0 95 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 LINC00474Q9P2X8 69 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-209ENST00000485765 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 RNF151Q2KHN1 245 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 ERASQ7Z444 233 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 ORAOV1Q8WV07 137 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 LINC01549A6NIU2 74 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 KIAA0087Q14695 138 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 STPG4Q8N801 248 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 S100A6P06703 90 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 PTTG1IPP53801 180 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BKO60814 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BJP06899 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BOP23527 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BBP33778 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BDP58876 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BCP62807 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 LINC00614P0C842 121 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 NDUFA1O15239 70 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 SEC11AP67812 179 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 C10orf25Q5T742 122 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-209ENST00000485765 A0A0J9YXV3 536 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-209ENST00000485765 HSBP1O75506 76 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-209ENST00000485765 HERVK_113P63121 156 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-209ENST00000485765 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-209ENST00000485765 HERC1Q15751 4861 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms