RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE2BQ13066 116 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 C5orf38Q86SI9 138 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 RAB5AP20339 215 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 APOC3P02656 99 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 MT1HL1P0DM35 61 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 SVBPQ8N300 66 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 SNAPINO95295 136 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 APOMO95445 188 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0J9YXV3 536 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 PTTG1IPP53801 180 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 SPAG11BQ08648 103 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 COX19Q49B96 90 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 IFITM10A6NMD0 228 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 Q8N8P6 123 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 PRSS47A8MTI9 375 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 MT-ND6P03923 174 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZRP5 223 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 C2orf48Q96LS8 159 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 TNXBP22105 4242 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1W2PNN7 141 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 K7EMI3 77 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 G0S2P27469 103 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 FAM104AQ969W3 186 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-212ENST00000468164 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFA1O15239 70 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 ODF1Q14990 250 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 REG3GQ6UW15 175 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01600Q96MT4 127 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 C10orf25Q5T742 122 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZN92 141 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 RNF151Q2KHN1 245 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE2EQ4V326 116 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 C1orf137Q5JT78 98 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM141Q96I45 108 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 FAM168BA1KXE4 195 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 FA2HQ7L5A8 372 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 VCX2Q9H322 139 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-212ENST00000468164 A0A087WZ39 114 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 C2orf82Q6UX34 121 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01549A6NIU2 74 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 F8WDY8 70 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 NPSP0C0P6 89 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2D1P51668 147 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 TOMM6Q96B49 74 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-212ENST00000468164 PRSS2P07478 247 aa8.24□□□□□ -1.09
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